Las reconstrucciones de tejido cerebral a partir de imágenes de microscopÃa electrónica (EM) de especies de invertebrados y vertebrados han aumentado en escala y complejidad, con la ayuda de la automatización de la adquisición de imágenes. Este enfoque combinado de estructura y función se ha aplicado a la corteza visual primaria (V1) del ratón, pero anteriormente se limitaba a decenas de células.
En este artÃculo se presenta una reconstrucción semiautomática de la corteza visual primaria del ratón L2/3 a partir de ~250 × 140 × 90 μm3 de imágenes microscópicas electrónicas, incluidas neuronas piramidales y no piramidales, astrocitos, microglÃa, oligodendrocitos y precursores, pericitos, vasculatura, núcleos, mitocondrias y sinapsis. Se incluyen las respuestas visuales de un subconjunto de células piramidales.
Los datos están disponibles públicamente, junto con herramientas de acceso programático e interactivo tridimensional. Breves viñetas ilustran la amplitud de las aplicaciones potenciales que relacionan la estructura con la función en los circuitos corticales y la biologÃa de las células neuronales. Las mitocondrias y la organización de las sinapsis se caracterizan en función de la longitud del trayecto desde el soma. Las frecuencias de motivos de conectividad piramidal se predicen con precisión utilizando un modelo de configuración de gráficos aleatorios. Las células piramidales que reciben más conexiones de células cercanas exhiben respuestas visuales más fuertes y confiables. El código de ejemplo muestra el acceso y el análisis de los datos.
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